Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gimd1E9PW74 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gimd1E9PW74 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gimd1E9PW74 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms