Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930444P10RikD3YUR1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms