Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otud4B2RRE7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms