Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp42B2RQC2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms