Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Svep1A2AVA0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Svep1A2AVA0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms