Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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