Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Knop1Q9Z2Q2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms