Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D8

Zkscan5, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 5, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan5Q9Z1D8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan5Q9Z1D8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan5Q9Z1D8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zkscan5Q9Z1D8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms