Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt71Q9R0H5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms