Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpc3Q9QZC1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc3Q9QZC1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms