Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Bcl11aQ9QYE3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11aQ9QYE3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms