Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Csnk1eQ9JMK2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk1eQ9JMK2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms