Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Txnrd1Q9JMH6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Txnrd1Q9JMH6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Txnrd1Q9JMH6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Txnrd1Q9JMH6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Txnrd1Q9JMH6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Txnrd1Q9JMH6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Txnrd1Q9JMH6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Txnrd1Q9JMH6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Txnrd1Q9JMH6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms