Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmx1aQ9JKU8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmx1aQ9JKU8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.3 ms