Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herpud1Q9JJK5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Herpud1Q9JJK5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms