Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Riox1Q9JJF3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Riox1Q9JJF3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms