Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco4Q9JIS3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smco4Q9JIS3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms