Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LratQ9JI60 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LratQ9JI60 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms