Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mkrn2Q9ERV1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mkrn2Q9ERV1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn2Q9ERV1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms