Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Stx12Q9ER00 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx12Q9ER00 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms