Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r50Q9EP51 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r50Q9EP51 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms