Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Swt1Q9DBQ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Swt1Q9DBQ9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Swt1Q9DBQ9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 577.5 ms