Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D5Q8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D5Q8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D5Q8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms