Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efhd1Q9D4J1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhd1Q9D4J1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhd1Q9D4J1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms