Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx28Q9CWT6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ddx28Q9CWT6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx28Q9CWT6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms