Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl27Q99N92 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mrpl27Q99N92 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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