Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a6bQ99N09 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms