Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gps1Q99LD4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms