Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlgn1Q99K10 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlgn1Q99K10 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlgn1Q99K10 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms