Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krcc1Q99JT5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms