Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Alpk3Q924C5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Alpk3Q924C5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Alpk3Q924C5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Alpk3Q924C5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Alpk3Q924C5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms