Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc159Q8C963 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc159Q8C963 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc159Q8C963 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc159Q8C963 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms