Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfibp1Q8C8U0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms