Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem260Q8BMD6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem260Q8BMD6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms