Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms