Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil2Q6R2P8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil2Q6R2P8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms