Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrrn2Q6PHP6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrn2Q6PHP6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn2Q6PHP6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms