Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ggnbp1Q6K1E7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ggnbp1Q6K1E7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms