Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clcn1Q64347 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clcn1Q64347 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
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