Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt12Q64291 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt12Q64291 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt12Q64291 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms