Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup62Q63850 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup62Q63850 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms