Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtcfQ61164 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtcfQ61164 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CtcfQ61164 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CtcfQ61164 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtcfQ61164 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtcfQ61164 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtcfQ61164 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtcfQ61164 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtcfQ61164 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtcfQ61164 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtcfQ61164 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtcfQ61164 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtcfQ61164 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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