Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm1Q60636 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm1Q60636 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms