Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
9930111J21Rik1Q5SVP0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms