Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tns3Q5SSZ5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tns3Q5SSZ5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms