Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm12185Q5NCB2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm12185Q5NCB2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm12185Q5NCB2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm12185Q5NCB2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm12185Q5NCB2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm12185Q5NCB2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm12185Q5NCB2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm12185Q5NCB2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm12185Q5NCB2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Gm12185Q5NCB2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm12185Q5NCB2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm12185Q5NCB2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms