Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkaa1Q5EG47 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkaa1Q5EG47 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms