Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc106Q3ULM0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc106Q3ULM0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms