Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CiartQ3TQ03 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CiartQ3TQ03 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms