Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrx1Q3TL44 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrx1Q3TL44 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrx1Q3TL44 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms